Vazebný protein pro auxin (ABP)

Také v oblasti struktury a funkce složitých velkých látek (makromolekul) nám může být 3D tisk významným pomocníkem. Tento model představuje komplex proteinu vážícího auxin (ABP - Auxin Binding Protein). Vzhledem k významné roli auxinu je model využitelný jak v chemii, tak v biologii.

Konkrétně se jedná o komplex auxin-vazebný protein 1 s naftyloctovou kyselinou (NAA). Data pochází z publikace: E.-J. Woo, J. Marshall, J. Bauly, J.-G. Chen, M. Venis, R.M. Napier, R.W. Pickersgill: Crystal structure of auxin-binding protein 1 in complex with auxin, EMBO J., 21 (2002), pp. 2877-2885. (PDB soubor). Aminokyseliny interagující s IAA (resp. NAA), jsou v modelu zvýrazněny. Zinečnatý kationt představuje malá samostatná kulička (viz foto dole). Model je vhodné doplnit malými magnety, které pak drží komplex pohromadě, a přitom umožní proteinovou část otevřít a prostudovat vlastní vazebné místo s navázanou molekulou.

e-Mole zpravodaj

Objednejte si zasílání novinek e-mailem! Váš e-mail bude použit pouze k zasílání informací o novinkách na našem webu. Odebírání e-mailového zpravodaje můžete kdykoli zrušit (váš email bude z naší databáze trvale odstraněn).